在深圳公司进行注册资本减资的流程及费用如下：

减资流程：

1. 发布减资公告：

   • 登录深圳市市场监督管理局官网，找到“商事主体登记注册（变更）”或“国家企业信用信息公示系统”。
   • 选择“减资公告”入口，填写公司相关信息。
   • 保存公告信息并下载公告文档，打印出来法人签名并盖章，上传扫描件。
   • 公告信息公示45天。

2. 股东会决议：

   • 召开股东会，制定减资方案，包括减资后的注册资本、股东利益安排等。
   • 股东会决议需2/3以上表决权通过。

3. 调整财务报表：

   • 编制资产负债表及财产清单。
   • 根据减资情况调整公司章程或修正案。

4. 通知债权人：

   • 对于未实缴出资的企业，需在10日内通知已知债权人，30日内在报纸或公示系统公告。
   • 债权人有权在30天或45天内要求公司清偿债务或提供担保。

5. 工商变更登记：

   • 公告期满后，登录深圳市市场监督管理局官网，进入“商事主体变更”。
   • 填写变更申请，上传股东会决议、资产负债表、财产清单、减资公告样本、公司章程修正案等。
   • 选择线上全流程办理（需法人或股东有数字证书）或预约线下窗口办理。

6. 税务变更：

   • 如涉及股东实缴部分的减资，需处理账务并可能涉及个人所得税或企业所得税的缴纳。
   • 减资后需更新税务登记信息。

费用：

• 公告费用：通常通过官方系统发布，无需额外费用。
• 会计师事务所费用：编制资产负债表和财产清单可能需要会计师事务所协助，费用依据事务所收费标准。
• 公章刻制费用：如需更换公章，费用约100-300元。
• 代理服务费：如委托专业机构代办，费用根据服务内容和机构收费标准而定，可能包括注册地址租赁、工商变更代理等，具体费用需咨询服务机构。
• 税务处理费用：根据减资情况，可能涉及账务调整、税务咨询和申报，费用根据情况而定。
• 其他可能的费用：如需要登报，可能产生报纸发布费用，以及可能的银行账户变更费用等。

注意事项：

• 确保减资后公司注册资本不低于法定最低限额。
• 减资过程需严格遵守《公司法》相关规定，避免法律风险。
• 减资涉及的税务问题需根据企业具体情况处理，可能涉及个人所得税或企业所得税的缴纳。
• 建议在减资前进行详细规划，必要时寻求专业法律和税务咨询。

以上流程和费用仅供参考，具体操作需根据公司实际情况和当地政策调整。