2026年转让公司股权时，增值税的计算主要取决于股权类型：企业转让上市公司股权需按卖出价减买入价后的余额缴纳6%增值税；非上市企业股权转让不征收增值税。

具体来说，企业转让上市公司股权时，增值税的计算依据金融商品转让税目，以卖出价减去买入价后的余额作为计税依据，税率为6%。例如，若企业以1000万元买入某上市公司股权，后以1200万元卖出，则需缴纳的增值税为（1200-1000）×6%=12万元。

对于非上市企业股权转让，由于股权不属于金融商品范畴，因此不征收增值税。这意味着，无论转让价格如何，非上市企业股权转让均无需缴纳增值税。

在深圳进行公司股权转让，核心需要缴纳的税种有三个：个人所得税（个人股东）、企业所得税（企业股东）和印花税（双方都缴）。其中，个人所得税是大家关注最多的部分

深圳公司股权转让（非上市）核心税费：印花税（双方）+ 所得税（转让方）；上市公司股权另缴增值税。
一、印花税（必缴，双方）
• 税率：0.05%（万分之五）；小规模/自然人减半征收（至2027年底）
• 计税：合同所载转让金额 × 税率
• 示例：100万转让，双方各缴500元；减半后各250元
二、所得税（仅转让方）
1. 个人股东（自然人）
• 税种：个人所得税（财产转让所得）
• 税率：20%
• 公式：(转让收入 − 股权原值 − 合理税费) × 20%
• 扣缴：受让方代扣代缴；深圳税务前置，完税才能工商变更
2. 企业股东（法人）
• 税种：企业所得税
• 税率：一般25%；小微企业/高新企业按优惠税率（20%/15%）
• 公式：(转让收入 − 股权计税成本 − 合理税费) × 适用税率
• 申报：并入当期应纳税所得额，季度/年度申报
三、增值税（仅上市公司股权）
• 非上市公司股权：不征增值税
• 上市公司股票（金融商品转让）：一般纳税人6%；小规模3%
• 公式：(卖出价 − 买入价) ÷ (1+6%) × 6%
四、关键提醒（深圳）
• 平价/低价转让：无正当理由（如亲属、亏损），税务可按净资产核定补税
• 流程：先税务完税 → 再工商变更，需完税凭证
• 申报：个人在自然人电子税务局；企业在电子税务局企业端